未来东部地区将面临着多方面的转型：发展理念实现从依托辐射、承接外溢向依托创新、强化内聚、提升功能转变；发展方式实现从分散决策、多头意志向集中决策、战略布局、整体发展转变；发展动力实现从区域边缘、成本洼地向区位提升、成本高地、区域节点转变。基于以上的发展转型的现实，目前存在以下几个方面的问题与挑战：产业结构调整和升级的动力不足；土地资源短缺；配套设施不足；环境品质较差；交通系统建设滞后；形象特征不突出以及跨境冲突问题。